Научный подход

Разработчик биоинформатической платформы (НИР)

Не указана
  • Краснодар
  • Полная занятость
  • Удаленная работа
  • От 1 года до 3 лет

О проекте

Приглашаем присоединиться к научно-исследовательскому проекту по разработке открытой биоинформатической платформы для анализа геномных данных. Проект реализуется в рамках гранта ФТ 2.1.

Обязанности

  • Анализ и разработка объектно-ориентированной модели для представления сценариев анализа генетических данных

  • Создание парсеров для языков CWL и WDL с использованием технологии JavaCC

  • Разработка генераторов кода на языках CWL, WDL и Nextflow

  • Формализация ограничений по отображению информации из сценариев анализа данных

  • Проектирование и реализация графической нотации для визуализации данных

  • Разработка веб-интерфейса для интерактивного просмотра и редактирования сценариев

  • Создание тестовых наборов данных для проверки разработанных компонентов

Требования

  • Высшее образование в области компьютерных наук/биоинформатики

  • Опыт разработки на Java и JavaScript

  • Знание языков CWL, WDL, Nextflow будет преимуществом

  • Опыт работы с UML диаграммами

  • Понимание принципов объектно-ориентированного программирования

  • Навыки работы с системами контроля версий (Git)

  • Умение работать с большими объемами данных

Условия

  • График работы: полный рабочий день

  • Срок проекта: до 01.12.2025

  • Место работы: Университет «Сириус», федеральная территория «Сириус»

Преимущества

  • Участие в значимом научном проекте

  • Работа с передовыми технологиями в области биоинформатики

  • Возможность публикации результатов исследования

  • Профессиональный рост в сфере разработки биоинформатических решений